最新發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新
中科院昆明植物研究所研究員高立志及團(tuán)隊(duì)宣布,運(yùn)用新一代高通量測(cè)序技術(shù)以及基于高性能超算的生物信息學(xué)分析,日前已完成普通野生稻基因組高覆蓋的序列測(cè)定、拼接和組裝工作,獲得了普通野生稻全基因組從頭測(cè)序的框架圖,基因組圖譜已達(dá)到國(guó)際領(lǐng)先的基因組圖譜標(biāo)準(zhǔn)。這是我國(guó)科學(xué)家自主完成的第一個(gè)野生稻全基因組測(cè)序計(jì)劃,也是世界首個(gè)高雜合度野生稻全基因組框架圖譜。
中國(guó)是亞洲栽培稻的起源地之一,水稻是中國(guó)第一大糧食作物,養(yǎng)活了80%以上的中國(guó)人口。普通野生稻是亞洲栽培稻的公認(rèn)祖先種,被列為國(guó)家二級(jí)保護(hù)植物,蘊(yùn)藏著許多尚未認(rèn)識(shí)與利用的優(yōu)異基因。由于它與栽培稻有著密切的親緣關(guān)系,迄今水稻常規(guī)育種取得的大多數(shù)突破無(wú)不與發(fā)掘利用該種野生稻的優(yōu)異基因相關(guān)。例如,袁隆平等利用海南島的一株雄性不育普通野生稻野敗中的細(xì)胞質(zhì)雄性不育基因,育成了聞名中外的雜交水稻。
此前,粳稻日本晴基因組的精細(xì)圖譜已經(jīng)獲得,秈稻9311基因組的框架圖譜也由我國(guó)科學(xué)家完成。現(xiàn)在普通野生稻全基因組框架圖譜的獲得以及精細(xì)圖譜的進(jìn)一步繪制,不僅大大地促進(jìn)水稻重要功能基因的規(guī)?;馕雠c鑒定,為進(jìn)一步發(fā)掘利用普通野生稻豐富的優(yōu)異基因資源提供了前所未有的機(jī)遇。
本項(xiàng)目的完成主要依托于2009年年底順利通過(guò)國(guó)家驗(yàn)收的國(guó)家大科學(xué)工程中國(guó)西南野生生物種質(zhì)資源庫(kù)先進(jìn)的基因組學(xué)與生物信息學(xué)平臺(tái)。測(cè)序結(jié)果已覆蓋92%的普通野生稻全基因組,基因覆蓋度約為90%以上。目前,項(xiàng)目組正在加緊繪制普通野生稻的基因組精細(xì)圖譜。
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